Die Heimat von Nothobranchius rachovii sind der Unterlauf des Pungwe in der Umgebung der Stadt Beira sowie das Einzugsgebiet des Sambesi in Mosambik. Dabei handelt es sich meist um temporäre, überschwemmte Sumpfgebiete mit schwankendem Wasserstand, die regelmäßig austrocknen.
